FileZilla სერვერი – ძლიერი FTP სერვერი მოწინავე კომპლექტი თვისებები. პროგრამა შედგება სერვერისგან, რომელიც მუშაობს სისტემის მომსახურებით და აპლიკაციას დისტანციური წვდომის მხარდაჭერით, რომელიც ამ სერვერს მართავს. FileZilla სერვერი მხარს უჭერს RTP, SFTP და FTPS პროტოკოლს და უზრუნველყოფს მონაცემთა დაცვის საიმედო დონეს SSL შიფრირების გამო. FileZilla სერვერი საშუალებას გაძლევთ შეზღუდოთ მომხმარებლის სერვერზე წვდომა, სერვერების ან შიდა IP მისამართების დაბლოკვა, გადამცემი ფაილების შეკუმშვის კოეფიციენტი, მაქსიმალური ჩამოტვირთვა სიჩქარის შეზღუდვა და ა.შ. FileZilla Server-ი აგროვებს აქტივობის სტატისტიკას FTP-ზე რეალურ დროში, რომელიც საშუალებას აძლევს მომხმარებლებს აღმოაჩინონ ფაილები ჩამოტვირთვისთვის ან უკანონო ქმედებებში ჩართული.